美國加征關稅對支撐日本經濟的汽車、鋼鐵、鋁等産業造成巨大沖擊；日本首相石破茂喻之爲“國難”，成立特别談判小組同美方周旋，并商讨通過發放輔助金與減稅等措施，支援國内産業，協助商企和民間緩沖。
美國加征關稅，首當其沖的當數日本汽車産業。内閣數據顯示，日本對美國的出口中，汽車和汽車零部件出口額爲7.2萬億日元（約660億新元），占日本整體出口約34.1%。特朗普上調關稅後，一般汽車出口到美國須承擔的關稅，将從原先的2.5%提高至27.5%，卡車關稅則從25%提高至50%。
估計有一成人口、超過1255萬人的生活将直接受沖擊。
石破茂星期五（4月11日）針對美國加征關稅召開綜合對策總部會議時指出，美方的關稅措施直擊支撐日本經濟的汽車、鋼鐵、鋁等産業，即使特朗普突然喊停，暫緩實施關稅90天，但加征關稅對日本經濟的影響仍難以預測。
他承諾，“政府将穩步協調企業融資等必要的支持，并在這種堪稱國家危機的形勢下，積極與美方接觸讨論，探索對日美兩國都有利的廣泛合作。”
執政聯盟公明黨提出，“最有效的措施就是通過減稅直接減輕家庭和企業的負擔”。消息指出，基于減稅需經法律程序，而夏季參院選舉逼近，當局或得先以現金發放津貼給民衆。執政兩黨考慮爲國民每人發放5萬日元的扶助金安撫民心。
日經濟部長下周訪美交涉
日本已成立專家小組研究特朗普措施的内容以及分析其影響。負責與美方談判的經濟部長赤澤亮下周訪美，與美國财長交涉。
他星期五在記者會上強烈敦促美國重新審視這些措施，并承諾将采取一切可能措施，爲日本國内産業提供必要的支持，包括企業融資。
日評論：美暫緩90天是爲談判加注籌碼 誘迫日産業赴美設廠
特朗普暫停對等關稅90天的目的是什麽？日本放送協會NHK分析指特朗普這麽做是爲了與包括日本在内的國家進行談判。NHK也公開了特朗普首個任期内的商務部長羅斯的訪談，羅斯指出日本是最早站出來表示要與美方“真誠談判”的國家，這給特朗普留下了好感。
此外，日本未祭出“反制關稅”，一些日本公司也已開始把生産轉移到美國；羅斯透露這正是特朗普想要達到的目的。
羅斯也認爲中國在談判中将面對困境，不排除特朗普意在孤立中國。他相信特朗普打擊中國還有個“非關稅壁壘”原因，就是不滿中國不尊重知識産權。對特朗普來說，“知識産權至關重要，尤其是科學型産業”。
他說：“沒人能預知事情會如何發展，哪一方又會如何做決定。随着各國與美國達成協議，中國可能被迫就已征收的關稅達成協議，所有從中國進入美國的産品都将被征收關稅。除非中國采取行動，否則美國出手還會更加嚴厲。”
